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学院现设有道路与机场工程系，交通工程系，运输管理工程系，交通信息工程系，道路与交通工程研究所，智能交通系统研究中心，交通信息通讯实验研究中心等单位，并拥有全国道路与交通领域唯一国家级实验室-教育部道路与交通工程重点实验室。
学院现有教职员工20多人，其中教授22名，副教授38名，博士研究生导师20名。学院现有在校本科生850多人，硕士研究生350多人，博士研究生100多人。2002年招收的本科生180多名，硕士研究生121名，2003年已录取硕士研究生118名。
交通运输工程学院是首批获得交通运输一级学科博士点的院校，拥有道路与铁路工程、交通运输规划与管理、交通运输工程与控制、载运工具运用工程四个二级学科的博士点与研究点，以及道路与铁道工程和交通运输规划与管理博士后流动站。
交通运输工程学科为同济大学的优势学科和优先发展学科，先后被确定为上海市重点学科、国家重点学科和'211工程'重点建设学科。道路与铁道工程和交通信息工程与控制学科获得了"长江学者特娉教授岗位"。2001年道路与铁道工程、交通运输规划与管理被评为国家级重点学科。 | 
