物流企业可以是资产型企业，也可以是非资产型企业。事实上，有物流资产的物流企业更具有优势，拥有资产优势的以运输、仓储起家的“混合型”物流企业，发展壮大的机会更大。
    但不是所有的物流企业都拥有物流设施。美国1998年68%的物流企业是非资产性的。我国的物流企业之间、物流企业与工商企业之间也应该用协议、合作、联盟等方式展开协作，政府在税收政策上应给予配套扶持。比如，合资合作的物流企业所得税税率采用低税率，提供代理服务的物流企业采用3%的营业税税率，鼓励仓库的租赁使用，可以减征或免征租赁收入的营业税，房产税采用按房产余值的1.5%计税，租用仓库的物流企业的租赁支出可以一次性计入费用，降低所得税税基等。
    根据物流设施建设增量和盘活存量、软件和硬件并重的原则，政府在制定税收政策时，对于公益性物流基础设施的建设应给予全额税收优惠，可采用投资抵免的优惠办法，即投资主体投资于公益性物流基础设施建设，其投资额允许抵减企业所得税的税基。其他投资额大、投资回收期长的物流基础设施，如大型物流中心的建设，政府要加以规范引导，在全面规划和充分论证的基础上，充分发挥市场机制的作用，政府给予一定的税收优惠。
    针对我国物流业现有设施闲置率高的问题，政府应加大存量设施的盘活和整合的税收优惠力度，如对进行技术改造而购进固定资产的，在增值税方面允许抵扣固定资产所含税额。在企业所得税方面，允许固定资产采取加速折旧法，从而降低计税依据的数额。对企业处置不需用的固定资产，如果尚未提足折旧，允许报废时一次性提足折旧，计入税前利润。允许用新增所得税额抵免一定数额的投资额，从而降低所得税的税收负担。在营业税方面，为了提高物流设施的利用率，物流企业之间租赁设施时，免征营业税，若是房产设施，免征房产税。
    信息网络技术、计算机系统技术和通信技术在物流过程中的组合，是构成物流体系的重要组成部分，是物流业的软件设施，也是提高物流服务效率的重要技术保障。可借鉴以美国为代表的欧美国家的做法，将税收优惠作为政府推动物流企业技术创新的有效途径，通过制定形式多样的税收优惠政策，降低物流企业技术创新的税负，促进物流企业技术水平的提高。
    建议政府对于物流企业用于信息系统建设的资金，应允许抵免企业所得税或允许税前扣除，对软件研发人员的工薪收入在个人所得税方面给予优惠；对物流企业购进的信息网络技术、计算机系统技术和通信技术实行增值税进项税额抵扣，允许对固定资产加速折旧，加快技术设备的更新换代；利用税收优惠政策引导物流企业积极利用EDI、互联网等技术，促进企业内部资源配置优化。